Bin auf 4.9.13 (erster 4.9.x) zurück, Problem bleibt. Vielleicht ist es der Unterschied zwischen 4.4 und 4.9. Kann aber irgendwie nicht downgraden auf 4.4 ("sudo reboot" danach bewirkt nichts, will mir aber gerade das System nicht zerschießen da aus der Ferne zugreife).
Das aktuelle Raspbian zum Download hat Kernel 4.4. Sollte es wirklich an 4.9 liegen wird es irgendwann alle treffen wenn die Kernelversion mitgezogen wird, also auch Raspbian (Download) den 4.9-Kernel hat.
edit:
Also es war so dass nach Downgradeversuch auf den letzten 4.4er der Befehl "sudo reboot" nur bewirkte dass er in eine leere Zeile sprang, dabei keine 2. SSH-Verbindung mehr angenommen wurde (Connection refused), hab mit Strg+C abgebrochen und wieder rpi-update auf den neuesten Kernel gemacht. Um neuzustarten musste er vom Strom, mit Bangen dass er wieder erreichbar ist (das mache ich bei Fernzugriff über Neustart des Routers da der RPI drüber versorgt wird und dann die Versorgung kurz weg ist).
Ich lasse jetzt mal die Experimente sein, dazu muss ich vorher ein neues Backup der SD-Karte machen.